Hi Everyone,

I am adding residues (essentially  modified cysteines ) to the polypeptide chain.

e.g.  

HETATM    1  N2  PGR     0       1.743  -1.624  -0.731  1.00  0.00           N

HETATM    2  C1  PGR     0      -0.077  -0.207  -0.018  1.00  0.00           C

HETATM    3  C2  PGR     0       1.394  -0.544   0.203  1.00  0.00           C

HETATM    4  C3  PGR     0      -0.485   0.927  -0.717  1.00  0.00           C

HETATM    5  C4  PGR     0      -1.034  -1.073   0.503  1.00  0.00           C

HETATM    6  C5  PGR     0      -1.840   1.189  -0.887  1.00  0.00           C

HETATM    7  C6  PGR     0      -2.389  -0.810   0.331  1.00  0.00           C

HETATM    8  C7  PGR     0      -2.794   0.323  -0.364  1.00  0.00           C

HETATM    9  C8  PGR     0       2.379   0.585  -0.085  1.00  0.00           C

HETATM   10  H1  PGR     0       1.529  -0.961   1.213  1.00  0.00           H

HETATM   11  H2  PGR     0       0.232   1.599  -1.120  1.00  0.00           H

HETATM   12  H3  PGR     0      -0.727  -1.940   1.035  1.00  0.00           H

HETATM   13  H4  PGR     0      -2.145   2.053  -1.418  1.00  0.00           H

HETATM   14  H5  PGR     0      -3.116  -1.477   0.733  1.00  0.00           H

HETATM   15  H6  PGR     0      -3.837   0.527  -0.497  1.00  0.00           H

HETATM   16  H7  PGR     0       1.655  -1.298  -1.705  1.00  0.00           H

HETATM   17  H8  PGR     0       1.143  -2.449  -0.581  1.00  0.00           H

HETATM   18  O18 PGR     0       3.393   0.026  -0.528  1.00  0.00           O

HETATM   19  SG  PGR     0       2.777   1.511   1.356  1.00  0.00           S

HETATM   20  CB  PGR     0       1.349   2.524   1.801  1.00  0.00           C

HETATM   21  CA  PGR     0       1.698   3.446   2.926  1.00  0.00           C

HETATM   22  N   PGR     0       0.565   4.254   3.182  1.00  0.00           N

HETATM   23  C   PGR     0       2.646   4.407   2.450  1.00  0.00           C

HETATM   24  O24 PGR     0       2.145   5.309   1.717  1.00  0.00           O

HETATM   25  O25 PGR     0       3.976   4.409   2.828  1.00  0.00           O

HETATM   26  H9  PGR     0       1.980   1.252  -0.806  1.00  0.00           H

HETATM   27  H11 PGR     0       1.044   3.140   0.942  1.00  0.00           H

HETATM   28  H12 PGR     0       0.527   1.867   2.099  1.00  0.00           H

HETATM   29  H13 PGR     0       2.043   2.881   3.803  1.00  0.00           H

HETATM   30  H14 PGR     0      -0.245   3.721   3.480  1.00  0.00           H

HETATM   31  H15 PGR     0       0.359   4.821   2.336  1.00  0.00           H

TER

My question is: How do I set up Isolde so that it can refine the structure?

 

Many thanks,

Trevor Sewell