Hi Tom, Thanks for your answer. You're right, the error arises from some text labels I didn't delete. Best regards, El mié, 8 sept 2021 a las 20:24, Tom Goddard (<goddard@sonic.net>) escribió:

Hi Diego,

Saving an STL file should not give that error, and when I test it with --nogui --script it does not give this error. What does give that error is when you try to save an image when you have text labels in the graphics because it needs the graphical interface to get fonts.

If this does not explain your error use ChimeraX Help / Report a Bug and attach your python script.

Tom

Here was my test code

from chimerax.core.commands import run run(session, 'open 1a0m') run(session, 'molmap #1 5') run(session, 'close #1') run(session, 'save test.stl')

On Sep 8, 2021, at 7:59 AM, Diego Amaya via ChimeraX-users < chimerax-users@cgl.ucsf.edu> wrote:

Hi,

I'm running a python script in --nogui and --script mode and I'm getting an error when doing rc(session, 'save surface.stl format stl'). The error message is :

*QGuiApplication::font(): no QGuiApplication instance and no application font set.Segmentation fault*

I'm working with debian 10 and I used the production release 1.2.5-1

Thanks in advance for the help.

-- Diego A. Amaya Ramírez

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